由于我國迄今未能建立起適應(yīng)投資基金特點的稅收政策體系，三種組織形式的投資基金均面臨嚴重的稅收問題。
　　1、將契約型公募證券基金視為個人投資者征稅。導(dǎo)致機構(gòu)投資者需承擔額外稅負：契約型私募基金則處于稅收盲區(qū)。按照企業(yè)所得稅法，法人企業(yè)投資于包括上市公司在內(nèi)的法人企業(yè)，股息紅利作為稅后收益無需繳稅；公益機構(gòu)的投資收益原本也屬于免稅收益。但是，機構(gòu)通過基金投資上市公司時，基金取得的股息紅利需比照個人投資者，由上市公司代扣代繳股息紅利稅，就需承擔額外的股息紅利稅。規(guī)模龐大的契約型私募基金則由于不進行工商登記，一直處于稅收征管盲區(qū)：不僅基金不作為納稅主體，投資者也不繳稅。
　　2、將公司型基金視為法人企業(yè)征稅，導(dǎo)致雙重征稅。一是基金需繳納企業(yè)所得稅，二是投資者個人還需再繳納個人所得稅，兩個環(huán)節(jié)合計稅負高達40%。
　　3、將合伙型基金視為一般合伙企業(yè)。導(dǎo)致國家稅收政策面臨無法實施的尷尬境地。地方普遍施行越權(quán)減免稅政策。
　　基于目前的投資基金征稅亂象，亟待重構(gòu)投資基金所得稅體系。筆者建議：
　　1、對符合投資管道條件的各類基金，統(tǒng)籌考慮給予稅收透明體待遇。雖然企業(yè)所得稅法規(guī)定法人企業(yè)是企業(yè)所得稅的納稅人，但依據(jù)該法第三十六條，國務(wù)院有權(quán)以稅收優(yōu)惠方式，特別規(guī)定符合投資管道條件的公司型基金由投資者繳納所得稅。
　　2、暫宜統(tǒng)一由基金管理機構(gòu)為個人履行代扣代繳義務(wù)，切實防范各類避稅行為。
　　3、配合推出資本利得稅，鼓勵進行長期投資。對投資未上市企業(yè)滿3年的，其轉(zhuǎn)讓股權(quán)所獲得的資本利得，建議減半征稅；對投資滿5年的，建議減按l/4征稅。對證券基金轉(zhuǎn)讓上市股票的所得，鑒于目前股市狀況，可考慮繼續(xù)暫免征稅。
　　4、改進創(chuàng)投基金應(yīng)納稅所得抵扣政策，將享受抵扣主體從基金轉(zhuǎn)為投資者。將各類符合投資管道條件的投資基金視為非納稅主體，在投資者環(huán)節(jié)繳稅后，就可將現(xiàn)行創(chuàng)投基金應(yīng)納稅所得抵扣政策的享受主體從基金轉(zhuǎn)為投資者。如此統(tǒng)籌設(shè)計后，稅收優(yōu)惠政策的效果就不會被雙重征稅大打折扣，將之推廣到其他組織形式也不再存在加劇稅負不公問題。(摘自《中國社科院要報》)