科技投入機制是科技體制的重要組成部分，科學(xué)合理的科技投入機制有助于促進(jìn)科技創(chuàng)新、提高科技創(chuàng)新績效。科技投入機制主要涉及投資主體和投資從何而來兩個問題。完善科技投入機制，也應(yīng)從這兩個方面著手。
　　科技投資主體一般來講是多元的，政府、企業(yè)、個人都可以成為投資的主體。那么，在一個國家或地區(qū)中，誰是科技投資的主要力量？在我國，目前政府是科技投資的主要力量。這種體制在短期內(nèi)或在一些基礎(chǔ)性、前瞻性和大型科技投資領(lǐng)域具有優(yōu)勢，但從長期來看也存在明顯的問題和缺陷，主要表現(xiàn)為：第一，政府作為科技投資的主體，容易導(dǎo)致產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)同質(zhì)化。由于人們的有限理性，地方政府組織融資和操辦項目，直接決定發(fā)展哪些產(chǎn)業(yè)、對什么項目進(jìn)行投入，容易造成各地產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)同質(zhì)化。第二，政府作為科技投入的主體，不利于分散風(fēng)險。例如，高新技術(shù)發(fā)展處在前沿領(lǐng)域，開發(fā)和應(yīng)用風(fēng)險大、失敗率高。即使是風(fēng)險投資比較發(fā)達(dá)的美國，成功利用高新技術(shù)發(fā)展成為世界500強大公司的也僅占5%—10%，而完全失敗的達(dá)到30%。政府直接投入雖然規(guī)模大，但如果失敗損失也大。
　　投資從何而來，在一定程度上決定著資金的使用效率。現(xiàn)實情況表明，這些年我們在科技方面的投資并不少，但取得的具有獨創(chuàng)性的成果與預(yù)期相比還有較大差距。這其中的原因雖然是多方面的，但科技投入主要來自政府是一個重要原因。如果采用行政方式分配資源，那么，科技人員的眼睛就不是盯著市場而是盯著政府，就難以把科技人員的主要精力引導(dǎo)到科技創(chuàng)新和滿足市場需求上。而激勵機制的扭曲，必然導(dǎo)致科技投資效率低下。
　　我國的科技投入機制是在計劃經(jīng)濟(jì)時期形成的，曾經(jīng)發(fā)揮過重要作用。但隨著我國社會主義市場經(jīng)濟(jì)的發(fā)展和經(jīng)濟(jì)科技發(fā)展水平的提高，政府主導(dǎo)的科技投入機制已不適應(yīng)新形勢新要求。因此，應(yīng)加快改革調(diào)整，建立健全適應(yīng)發(fā)展社會主義市場經(jīng)濟(jì)要求的科技投入機制。具體地說，可以從以下兩個方面著手。
　　逐步使企業(yè)和個人成為科技投資的主體，改變政府投資所占比重過大的局面。在市場經(jīng)濟(jì)條件下，科技投入的主體應(yīng)該是企業(yè)和個人，政府投資只能起激勵和引導(dǎo)作用。經(jīng)濟(jì)學(xué)研究表明，公共投資的增長對私人投資有兩種影響：一種是刺激私人擴大投資；一種是當(dāng)公共投資額超過一定水平時，私人投資減少，即私人投資被公共投資“擠出”。從目前我國的情況來看，政府直接掌握過多的科技投資資源，既不利于形成科技創(chuàng)新的競爭擇優(yōu)機制，也不利于企業(yè)和個人增加科技投入。應(yīng)加快科技體制改革，逐步使企業(yè)和個人成為科技投資的重要主體，政府投資則主要在基礎(chǔ)性領(lǐng)域發(fā)揮作用。
　　進(jìn)一步深化改革，引導(dǎo)更多的民間資本投入科技創(chuàng)新領(lǐng)域。近年來，我國民間資金更多地流向資本市場、資產(chǎn)市場，而不是實體經(jīng)濟(jì)和科技創(chuàng)新領(lǐng)域。應(yīng)進(jìn)一步加快綜合配套改革，完善要素市場，降低準(zhǔn)入門檻，健全激勵機制，鼓勵市場競爭，保護(hù)知識產(chǎn)權(quán)，吸引和鼓勵民間資本進(jìn)入科技創(chuàng)新領(lǐng)域，真正形成多元投入的市場化科技創(chuàng)新機制，進(jìn)而促進(jìn)科技創(chuàng)新、提高創(chuàng)新績效。