目前新醫(yī)改爭議最多的地方，發(fā)生在基本藥物制度上。爭議主要發(fā)生在兩大部門之間———衛(wèi)生部和人保部。11月5日《21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報道》稱之為：衛(wèi)生部人保部激烈爭議新醫(yī)改基本醫(yī)藥制度。

　　爭議主要在兩個焦點(diǎn)展開：一個是新目錄之爭，即：是要保留現(xiàn)行《醫(yī)保目錄》還是要重修《基本藥物目錄》；二是基本藥物制度的生產(chǎn)供應(yīng)模式，衛(wèi)生部要定點(diǎn)生產(chǎn)、直接配送，統(tǒng)一定價，并“強(qiáng)制”醫(yī)療機(jī)構(gòu)使用，而人保部要發(fā)揮醫(yī)保機(jī)構(gòu)作為藥品主要付費(fèi)者的“團(tuán)購”力量，與藥品供方談判出一個合理的基本藥物價格。
　　《醫(yī)保目錄》與《基本藥物目錄》，在外行看來無非只是一個稱謂問題，然而對于人保部和衛(wèi)生部這兩個不同的編制者來說，意味著采納哪個部門提出的基本藥物目錄，誰就主導(dǎo)基本藥物采購、生產(chǎn)、供應(yīng)等的整個鏈條：衛(wèi)生部要單設(shè)基本藥物供應(yīng)體系，從生產(chǎn)到使用一管到底；而人保部要發(fā)揮團(tuán)購力量實(shí)行基本藥物集中采購。
　　再來看各自的方案本身。衛(wèi)生部的方案有明顯的計劃色彩，如何實(shí)施有效監(jiān)管，防止滋生定點(diǎn)壟斷，鏟除權(quán)力尋租空間，恐怕是一個不太好解決的難題，人保部有關(guān)人士也敏銳地指出了這一點(diǎn)。可是，反過來醫(yī)保機(jī)構(gòu)也不能充當(dāng)真正意義上的市場力量，由它來和藥品生產(chǎn)者談判議價，是否也同樣存在著尋租空間？
　　如果所謂“激辯”，只是指出對方方案中的缺陷，而無視同樣的缺陷亦存在于自身，只是要以“我的不完善方案”來代替“你的不完善方案”，那么“激辯”將無法達(dá)到完善基本藥物制度，讓民眾滿意的目的。
　　筆者認(rèn)為，既然是對基本藥物制度的“激辯”，當(dāng)然應(yīng)該以基本藥物制度為核心，一切都應(yīng)該是為了完善基本藥物制度著想。顯然，完善基本藥物制度的關(guān)鍵，不在于把主導(dǎo)權(quán)給誰更好，這是沒有完美答案的；而在于對相關(guān)權(quán)力實(shí)施怎樣的約束與監(jiān)督，才能使基本藥物制度的設(shè)計初衷真正得以實(shí)現(xiàn)。