國務院辦公廳
國務院所屬各部委（27個）
外交部
國防部 發(fā)展改革委 教育部 科技部 工業(yè)和信息化部 國家民委 公安部 安全部 監(jiān)察部
民政部 司法部 財政部 人力資源社會保障部 國土資源部 環(huán)境保護部 住房城鄉(xiāng)建設(shè)部
交通運輸部 鐵道部 水利部 農(nóng)業(yè)部 商務部 文化部 衛(wèi)生部 人口計生委 人民銀行 審計署
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監(jiān)察部與中共中央紀檢委機關(guān)合署辦公，機構(gòu)列入國務院序列，編制列入中共中央直屬機構(gòu)。
國務院直屬特設(shè)機構(gòu)
國資委
國務院直屬機構(gòu)
海關(guān)總署 稅務總局 工商總局 質(zhì)檢總局 廣電總局 新聞出版總署 （版權(quán)局） 體育總局
安全監(jiān)管總局 統(tǒng)計局 林業(yè)局 知識產(chǎn)權(quán)局 旅游局 宗教局 參事室 國管局 預防腐敗局
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國家預防腐敗局于2007年9月13日宣布成立，列入國務院直屬機構(gòu)序列，在監(jiān)察部加掛牌子。
國務院辦事機構(gòu)
僑辦 港澳辦 法制辦 國研室 臺辦 * 新聞辦 * 檔案局 *
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國務院臺灣事務辦公室與中共中央臺灣工作辦公室、國務院新聞辦公室與中共中央對外宣傳辦公室，一個機構(gòu)兩塊牌子，列入中共中央直屬機構(gòu)序列。國家檔案局與中央檔案館，一個機構(gòu)兩塊牌子，列入中共中央直屬機關(guān)的下屬機構(gòu)。
國務院直屬事業(yè)單位
新華社 中科院 社科院 工程院 發(fā)展研究中心 行政學院 地震局 氣象局 銀監(jiān)會 證監(jiān)會 保監(jiān)會
電監(jiān)會
社�；饡� 自然科學基金會
國務院部委管理的國家局
信訪局 糧食局 能源局 國防科工局 煙草局 外專局 公務員局 海洋局 測繪局
民航局 郵政局 文物局 食品藥品監(jiān)管局 中醫(yī)藥局 外匯局 煤礦安監(jiān)局
保密局 * 密碼局 * 航天局 * 原子能機構(gòu) * 國家語委 * 核安全局 *
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國家保密局與中央保密委員會辦公室、國家密碼管理局與中央密碼工作領(lǐng)導小組辦公室，一個機構(gòu)兩塊牌子，列入中共中央直屬機關(guān)的下屬機構(gòu)。工業(yè)和信息化部對外保留國家航天局、國家原子能機構(gòu)牌子。教育部對外保留國家語言文字工作委員會牌子。環(huán)境保護部對外保留國家核安全局牌子。